INFEKSI VIRUS CORONA 19(COVID19)

Masa inkubasi

(Pembaruan terbaru 30 Juni 2020)

Perkiraan saat ini menunjukkan periode inkubasi rata-rata dari lima hingga enam hari untuk COVID-19, dengan rentang dari dua hingga 14 hari. Studi pemodelan menunjukkan bahwa masa inkubasi bisa dari 2,3 hari (95% CI, 0,8-3,0 hari) sebelum onset gejala dan hingga 14 hari.

Patologi dan patogenesis

(Pembaruan terbaru 20 Juni 2020)

Temuan histologis dari paru-paru termasuk kerusakan alveolar difus yang mirip dengan cedera paru-paru yang disebabkan oleh virus pernapasan lain, seperti MERS-CoV dan virus influenza. Ciri khas infeksi SARS-CoV-2 adalah kerusakan vaskular, dengan cedera endotel yang parah, trombosis yang meluas, mikroangiopati dan angiogenesis.

Penumpahan  virus(viral shedding)

(Pembaruan terbaru 10 Agustus 2020)

Penumpahan virus RNA lebih tinggi pada saat onset gejala dan menurun setelah beberapa hari atau minggu. Selama infeksi, RNA virus telah diidentifikasi dalam spesimen saluran pernapasan 1-2 hari sebelum timbulnya gejala dan dapat bertahan hingga delapan hari pada kasus ringan, dan untuk periode yang lebih lama pada kasus yang lebih ringan. kasus yang parah, memuncak pada minggu kedua setelah infeksi. Penumpahan RNA virus yang berkepanjangan telah dilaporkan dari usap nasofaring (hingga 67 hari di antara pasien dewasa) dan dalam tinja (lebih dari satu bulan setelah infeksi pada pasien anak). Virus menular telah terdeteksi hingga hari kedelapan setelah onset penyakit .

Late viral RNA clearance  (≥15 hari setelah onset penyakit), dikaitkan dengan jenis kelamin laki-laki, usia tua, hipertensi, keterlambatan masuk ke rumah sakit, penyakit parah saat masuk, ventilasi mekanis invasif, dan pengobatan kortikosteroid.

Deteksi RNA virus oleh PCR tidak sama dengan infektifitas, kecuali partikel virus infeksius telah dikonfirmasi melalui isolasi virus dan dikultur dari sampel tertentu. Namun, viral load dapat menjadi penanda yang berpotensi berguna untuk menilai tingkat keparahan penyakit dan prognosis: sebuah penelitian menunjukkan bahwa viral load pada kasus yang parah hingga 60 kali lebih tinggi dibandingkan pada kasus ringan. RNA subgenomik virus (sgRNA) memberikan bukti perantara replikatif SARS-CoV-2 dan telah terbukti berkorelasi cukup baik dengan virus menular dalam kultur. Dalam sebuah studi dari Hong Kong yang mencakup kasus COVID-19 yang didominasi ringan, deteksi sgRNA positif hingga delapan hari setelah onset gejala. Sebaliknya, RNA virus dapat dideteksi setelah berminggu-minggu dengan RT-PCR.

Dalam hal profil viral load, SARS-CoV-2 mirip dengan influenza, yang memuncak pada sekitar waktu timbulnya gejala, tetapi berbeda dengan SARS-CoV, yang memuncak pada sekitar 10 hari setelah gejala. onset gejala, dan MERS-CoV yang memuncak pada minggu kedua setelah onset gejala. Usia yang lebih tua juga dikaitkan dengan viral load yang lebih tinggi. Viral load yang tinggi mendekati onset gejala menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 dapat dengan mudah ditularkan pada tahap awal infeksi.

Viral RNA telah terdeteksi di feses, darah utuh , serum, saliva, spesimen nasofaring, urin; cairan mata, ASI dan dalam sampel plasenta atau membran janin. Sebuah korelasi telah disarankan antara isolasi virus yang layak dan viral load awal (yaitu batas siklus [Ct]).

Sejauh ini belum ada laporan penularan COVID-19 melalui zat asal manusia / substances of human origin (SoHO). Bukti lebih lanjut diperlukan untuk menilai pentingnya temuan terbaru dari RNA virus dalam cairan mani  dan ASI  untuk keamanan donasi mereka, karena infektivitas RNA yang terdeteksi dalam ASI dan cairan mani belum terbukti. Tiga organisasi di bidang kedokteran reproduksi bersama-sama mengeluarkan pernyataan tentang dimulainya kembali perawatan kesuburan yang telah dihentikan pada bulan Maret . Rekomendasi dalam pembaruan pertama dokumen teknis ECDC tentang keamanan pasokan SoHO di UE / EEA tetap valid.

Koinfeksi dan infeksi sekunder

(Pembaruan terbaru 30 Juni 2020)

Adanya patogen non-SARS-CoV-2 mungkin tidak memberikan kepastian bahwa pasien juga tidak menderita SARS-CoV-2. Di antara 116 usapan nasofaring pasien COVID-19 yang bergejala di California Utara, 20,7% positif untuk satu atau lebih patogen tambahan. Koinfeksi yang paling umum adalah rhinovirus / enterovirus (6,9%), virus pernapasan syncytial (5,2%), dan coronavirus musiman (4,3%). Pada 62 (8%) dari 806 pasien yang diidentifikasi dalam laporan yang diterbitkan, koinfeksi bakteri atau jamur dilaporkan selama masuk.